مقدمه: با توجه به اهمیت سرطان پروستات و گستردگی مطالعاتی که تاکنون بر روی عوامل خطر محیطی و ژنتیکی آن انجام گرفته است، هنوز ابعاد زیادی از جنبه های ژنتیکی آن ناشناخته است. یکی از ژن های مهارکننده تومور در این نوع سرطان ژن KLF6 می باشد که در سرطان پروستات دچار تغییرات ژنتیکی می شود. یکی از تغییرات ژنتیکی شایع در این ژن موتاسیون اگزون شماره 2 است که با پیش آگهی بیماری مرتبط می باشد. از آن جا که در مطالعات محدودی موتاسیون در ژن KLF6 بررسی شده است و وجود موتاسیون با عوامل محیطی و نیز شرایط جغرافیایی و نژادی مرتبط است، هدف این مطالعه، بررسی موتاسیون اگزون شماره 2 این ژن در افراد مبتلا به این سرطان در شهر اصفهان بود.روش ها: این مطالعه در سال 90-1388 در شهر اصفهان، بر روی 40 نمونه سرطان پروستات که از طریق پروستاتکتومی یا بیوپسی در افراد مبتلا به این بیماری به دست آمد انجام شد. برای تعیین موتاسیون اگزون شماره 2 ژن KLF6 استخراج DNA، تعیین کمیت و کیفیت DNA، تکثیر اگزون شماره 2 با انجام (Polymerase chain reaction) PCR و پلی اکریلامید ژل الکتروفورز انجام گرفت و اطلاعات جمع آوری شده تجزیه و تحلیل شد.یافته ها: 32 نفر (80 درصد) از بیماران بالای 60 سال سن داشتند. 7 مورد (17.5 درصد) از افراد مبتلا به سرطان پروستات، موتاسیون در اگزون شماره 2 ژن KLF6 داشتند. بین وجود موتاسیون در اگزون شماره 2 ژن KLF6 و سن افراد مبتلا به سرطان پروستات رابطه معنی داری وجود نداشت، در حالی که رابطه بین وجود موتاسیون در اگزون شماره 2 ژن KLF6 و درجه بندی تومور معنی دار بود.نتیجه گیری: فراوانی موتاسیون در اگزون شماره 2 ژن KLF6 در نمونه های سرطانی با درجه بندی بالاتر، بیشتر بود که می تواند نشانه پیش آگهی ضعیف در نمونه هایی باشد که اگزون شماره 2 ژن KLF6 در آن ها دچار موتاسیون شده است.

زمینه و هدف: در سلول هایسلول های یوکاریوت، DNA اطراف پروتئین هایپروتئین های هیستونی (H3 and H4، H2 B, H2 A) می پیچدمی پیچد و تشکیل نوکلئوزوم می دهدمی دهد. سازماندهیسازمان دهی کروماتین، یک نقش کلیدی در کنترل بیان ژن دارد. تعدیلات یا تغییرات اپی ژنتیک می تواندمی تواند باعث تغییرات برگشت پذیربرگشت پذیر ساختمان کروماتین شود که این تغییرات بر روی دسترسی فاکتورهاینسخه برداری به رشته DNA و بیان ژن تاثیرگذارتاثیر گذار است. تغییرات هیستون، یکی از موارد اپی ژنتیک است بوده که برای بیان ژن ضروری است. این تغییرات، حاصل تعادل بین فعالیت دو گروه از آنزیم هاآنزیم ها شامل هیستون استیل ترانسفراز و هیستون داستیلاز است. داستیلاسیون هیستون، ساختمان کروماتین را فشرده کرده و درنتیجه باعث خاموش شدن ژن می شودمی شود. ژن هایژن های سرکوب کنندهسرکوب کننده سرطان، نقش مهمی در جلوگیری از سرطان ایفا می کنندمی کنند. داستیله شدن هیستون این ژن هاژن ها باعث خاموش شدن ژن و ایجاد سرطان می گرددمی گردد. در این مقاله مروری که حاصل مطالعات گروه تحقیقاتی ما در محدودهمحدوه زمانی آبان ماهآبانماه سال 1396 لغایت تیرماه 1397 استمی باشد ما به بررسی اثر آنزیم هایآنزیم های هیستون داستیلاز در سرطان هایسرطان های دستگاه گوارش و غدد ضمیمه می پردازیمپرداخته شد. مواد و روش ها: برای این مطالعه، ما منابع آنلاین شامل Scopus, PubMed, and ISI جهت یافتن مقالات مرتبط با اثر آنزیم هایآنزیم های هیستون داستیلاز بر سرطان هایسرطان های دستگاه گوارش و غدد ضمیمه مورد بررسیموردبررسی قرار گرفتقرار دادیم. نتیجه گیری: در این مطالعه ما نتیجه گرفته شدیم که آنزیم هایآنزیم های هیستون داستیلاز از طریق داستیله کردن هیستون ژن هایژن های سرکوب کنندهسرکوب کننده سرطان می توانندمی توانند باعث ایجاد سرطان در دستگاه گوارش و غدد ضمیمه شوند.

لطفا برای مشاهده چکیده به متن کامل (PDF) مراجعه فرمایید.

زمینه و هدف: سرطان ریه، یکی از علل مرگ ومیر ناشی از سرطان با بیش از 2/1 میلیون مرگ سالیانه در دنیا است. علاوه بر تغییرات ژنتیک، تعدیلات اپی ژنتیک در ایجاد و پیشرفت سرطان دخیل است. اختلال در تنظیم تعدیلات اپی ژنتیک می تواند بر جنبه های مختلف بیولوژی سلول شامل رشد، تمایز و مرگ سلولی اثر بگذارد. دو مکانیسم متیلاسیون و دِاستیلاسیون بهترین مکانیسم های دخیل در غیرفعال شدن ژن های ضدتوموری هستند. مهار کننده های آنزیم هیستون دِاستیلاز یک، عامل جدیدی از عوامل درمان سرطان است. مطالعه حاضر برای بررسی اثر تریکواستاتین آ برروی بیان ژن های Histone deacetylase 1(HDAC 1) and CIP/KIP (p21CIP1/WAF1, p27KIP1, and p57KIP2)، مهار رشد سلولی و القاء آپوپتوز در سرطان ریه رده سلولی COR-L105 طراحی شد. روش کار: سلول های سرطانی ریه رده COR-L105 با داروی تریکواستاتین آ تریت و میزان زنده بون سلول، سلول های آپوپتوتیک و بیان ژن هایHistone deacetylase 1(HDAC 1) and CIP/KIP (p21CIP1/WAF1 p27KIP1, and p57KIP2) به ترتیب با تکنیک های MTT، فلوسیتومتری و ریل تایم مورد بررسی قرار گرفت. یافته ها: داروی تریکواستاتین آ بطور معنی داری باعث مهار رشد سلولی، القاء آپوپتوز، کاهش بیان ژن HDAC 1 و افزایش بیان ژن های p21CIP1/WAF1, p27KIP1, and p57KIP2 گردید. نتیجه گیری: داروی تریکواستاتین آ می تواند با مهار بیان ژن هیستون دِاستیلاز باعث افزایش بیان ژن های مهار کننده توموری p21CIP1/WAF1, p27KIP1, and p57KIP2 و القاء آپوپتوز در سلول های سرطانی ریه گردد.

زمینه و هدف: شایع­ترین بدخیمی غده تیروئید، سرطان پاپیلاری تیروئید (Papillary Thyroid Carcinoma-PTC) می­باشد و به نظر می­رسد که میکرو RNA (mir) های دخیل در PTC، بر تهاجم تومورها اثر می­گذارند. در این مطالعه به بررسی بیان mir-16-5p، mir-34b-5p، mir-146b-5p، mir-877-5p و Let-7f-5p در نمونه­ی سرم و بافت توموری تیروئید بیماران PTC پرداخته شده است. روش­ کار: در این مطالعه­ی مورد-شاهدی، تعداد 36 بیمار دارای PTC شامل 18 مورد تهاجمی و 18 مورد غیر تهاجمی وارد مطالعه شدند. بررسی بیان ژن با استفاده از روش real-time PCR انجام شده و مقادیر چند برابری تغییرات (FC) گزارش گردید. یافته ­ها: به طور خلاصه، mir-16 افزایش بیان معنادار در خون (2. 85= FC، 0. 024= P)، mir-34 کاهش بیان معنادار هم در خون (0. 19= FC، 0. 001> P) و هم در بافت تومور (0. 19= FC، 0. 001> P)، mir-146 افزایش بیان معنادار هم در خون (48. 10= FC، 0. 001> P) و هم در بافت تومور (60. 61= FC، 0. 001> P)، mir-877 کاهش بیان معنادار در خون (0. 22= FC، 0. 001> P)، و Let-7 کاهش بیان معنادار هم در خون (0. 09= FC، 0. 001> P) و هم در بافت تومور (0. 13= FC، 0. 001> P) را نشان دادند. نتیجه ­گیری: میکرو RNA های منتخب مورد بررسی ارتباط معناداری با تهاجمی بودن تومورهای PTC دارد. با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیک می­توان سعی در تبیین مکانیسم­های مرتبط نمود.

پیش زمینه و هدف: امروزه استفاده از siRNA برای خاموش سازی ژن ها به صورت فزاینده ای در حال افزایش است. هدف از مطالعه حاضر بررسی بیوانفورماتیکی و تجربی مهار ژن HMGA2 و تاثیر آن بر میزان بیان ژن های پایین دست (ژن های انکوژنی و سرکوب کننده توموری) در سلول های MDA-MB-231 تیمار شده با shRNA و siRNA اختصاصی HMGA2 است. مواد و روش کار: برای انجام این پژوهش بیوانفورماتیکی و تجربی، ابتدا داده های میکروآرایه از پایگاه داده GEO جمع آوری شده و با استفاده از جعبه ابزار شبکه عصبی (PNN) در نرم افزار MATLAB 2018a آنالیز شد. سپس siRNA اختصاصی HMGA2 طراحی و تهیه شد. انتقال siRNA به وسیله لیپوفکتامین صورت گرفته و بیان ژن HMGA2 و ژن های انکوژنی و سرکوب کننده توموری به روش Real-time PCR ارزیابی شد. یافته ها: نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی نشان داد که ژن HMGA2 ارتباط نزدیکی با ژن های پایین دست دارد، به طوری که تغییر در بیان ژن HMGA2 بیان ژن های پایین دست را نیز تحت تاثیر قرار می دهد. انتقال siRNA اختصاصی HMGA2 به داخل سلول MDA-MB-231 باعث مهار معنی دار (p< 0. 05) بیان ژن HMGA2 در مقایسه با گروه کنترل شد. به علاوه به دنبال سرکوب بیان ژن HMGA2، بیان ژن های انکوژنی (TERT) و سرکوب کننده تومور DEDD)) به صورت معنی داری (p< 0. 05) به ترتیب کاهش و افزایش یافتند. بحث و نتیجه گیری: ژن HMGA2 به دلیل ارتباط گسترده با ژن های انکوژنی و سرکوب کننده تومور انتخاب معقول برای هدف گیری و خاموش سازی به وسیله siRNA اختصاصی است. نتیجه مهار موفقیت آمیز بیان ژن HMGA2 و تاثیرپذیری بیان ژن های TERT و DEDD بعد از ترانسفکشن siRNA اختصاصی با نتایج حاصل از مطالعه بیوانفورماتیکی مطابقت دارد.

یکی از عوامل موثر در توموری شدن سلول ها، تغییر الگوی اپی ژنتیک است. فرآیندهای اپی ژنتیک به ویژه الگوی غیرطبیعی متیلاسیون ژن ها در سرطان های تیروئید نقش مهمی دارند و افزایش متیلاسیون در نواحی تنظیمی بسیاری از ژن های سرکوب کننده تومور از جمله PTEN، RASSF 1 A TIMP 3 و در نتیجه خاموش شدن آن ها در این نوع سرطان گزارش شده است. با توجه به اختصاصی بودن الگوی متیلاسیون ژن ها در انواع سلول های توموری، احتمال داده می شود که این ژن ها در یک مسیر انتقال پیام ویژه نقش داشته باشند. علاوه بر ژن های سرکوب کننده تومور، الگوی غیرطبیعی متیلاسیون در ژن های اختصاصی تیروئید از جمله ناقل سدیم/ید (NIS) و گیرنده هورمون تحریک کننده تیروئید (TSHR) نیز در توموری شدن سلول های تیروئید و پیشرفت سرطان موثر است. از طرف دیگر تغییر در الگوی بیانی این ژن ها یکی از دلایل اصلی مقاومت به درمان ید رادیواکتیو در افراد مبتلا به سرطان تیروئید محسوب می شود. با توجه به اهمیت نقش الگوی متیلاسیون در پاتوژنز سرطان های تیروئید، هدف این مطالعه مروری بررسی یافته های موجود در زمینه نقش الگوی غیرطبیعی متیلاسیون ژن های موثر در توموری شدن سلول های تیروئید می باشد.

زمینه و هدف: کارسینوم معده یکی از شایع ترین سرطان های انسانی است. به منظور درک فرایند شروع و پیشرفت این سرطان ژن های زیادی مورد بررسی قرار گرفته اند؛ اما مکانسیم دقیق سرطانزایی به طور کامل شناخته شده نیست. درماتوپونتین (DPT) یک پروتئین ماتریکس خارج سلولی است که فرایندهای سلولی فیزیولوژیکی متعددی را تنظیم می کند. هدف مطالعه حاضر ارزیابی بیان ژن DPT در سرطان معده است. مواد و روش ها: نمونه های بیوپسی مربوط به 50 بیمار مبتلا به سرطان معده و همچنین بافت مجار نرمال آن ها که با استفاده از عمل جراحی به دست آمده بودند، توسط روش real-time PCR مورد بررسی قرار گرفتند. سپس ما با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیکی تغییرات بیان ژن DPT را در دو کوهورت جداگانه از بیماران مبتلا به سرطان معده بررسی شد. به منظور اطلاع از اثرات بیان سطوح مختلف ژن DPT در میزان بقاء بیماران، آنالیز کاپلان-مایر انجام شد. در نهایت آنالیز جامع برای بیان ژن DPT در 16 سرطان مختلف انجام شد. یافته ها: نتایج تکنیک real-time PCR نشان داد میزان بیان ژن DPT در بافت توموری نسبت به بافت نرمال معده کاهش می یابد. همچنین میانگین بیان ژن DPT در مراحل مختلف سرطان معده به طور معنی داری کاهش نشان داد. آنالیز مدت زمان بقاء نشان داد که بیان mRNA ژن DPT با بقاء کلی بیماران همبستگی مثبت دارد. همچنین ارتباط معنی داری میان بیان ژن DPT و اندازه اولیه تومور مشاهده گردید. بررسی بیان این ژن در 16 سرطان مختلف نشان دهنده کاهش بیان آن در بافت توموری نسبت به بافت نرمال مجاور است. نتیجه گیری: این نتایج پیشنهاد می کنند که کاهش بیان ژن DPT در بافت معده، احتمالاً نقش مهمی در ایجاد و پیشرفت سرطان معده دارد.